影响高效毛细管电泳色谱仪谱带展宽的因素有焦耳热、扩散和吸附等。

一、焦耳热：

电流通过毛细管内的缓冲液时产生的自热称为焦耳热。

焦耳热通过管壁向周围环境散热，管中心温度较高，由中心向管壁温度逐渐下降。温度高，粘度小，因而管中心的组分迁移较快，管壁附近的组分迁移较慢，破坏了溶质带的扁平塞子流型，导致谱带展宽。

大内径毛细管，电阻小，电流大，产生的焦耳热多，且不易散热。小内径毛细管散热面积大，温度梯度小，谱带展宽小。但内径过小会带来进样和检测等困难，又易造成柱堵塞。因此，目前多采用内径25～75μm的毛细管。

二、扩散：

扩散是物质分子由高浓度区域自发迁移到低浓度区域的过程。扩散会引起谱带展宽。

扩散系数小的物质，谱带展宽较小。

三、吸附：

溶质与毛细管壁之间存在吸附和疏水作用，使迁移速度减慢，造成谱带展宽。

造成管壁吸附的主要原因：

1、电解质溶液pH＞3时，石英毛细管壁带负电荷，因静电引力，溶质阳离子被管壁吸附。

2、蛋白质和多肽带电荷数多，有较多的疏水基，疏水作用较强，是目前分离分析该类物质的一大难题。在pH＜3时，管壁呈电中性时尤为明显。

小内径毛细管有利于散热，但比表面积大（柱内表面积和体积之比），会使吸附增加，引起谱带展宽大。