高效毛细管电泳色谱仪（HPCE）是以毛细管为分离通道，以高压直流电场为驱动力，利用带电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离，主要应用领域是生命科学，分离对象主要涉及氨基酸、多肽、蛋白质和核酸等生物分子。HPCE一开始就紧紧地结合这一重点应用领域，开展了消除毛细管壁吸附和提高分离度等一系列研究。至今，HPCE分离蛋白质有了很大进展，分离效率达到10⁵～10⁶理论塔板数，样品已从模型蛋白质转到生物工程等实际样品。对蛋白质结构分析具有重要意义的肽图，对人体基因工程有决定性作用的DNA测序等许多当代生命科学中的分离分析问题，HPCE都已涉足。