高效毛细管电泳色谱仪电泳淌度又称电泳迁移率，是指带电颗粒在高效毛细管电泳仪毛细管中单位电场下的泳动速度。影响电泳迁移率的因素有内在因素和外界因素。
一、影响电泳迁移率的内在因素：
1、颗粒所带净电荷量：
颗粒迁移率与颗粒所带净电荷量成正比。
2、颗粒大小和形状：
颗粒直径小而接近于球形，在电场中泳动速度快。
3、DNA构象：
一般迁移率为超螺旋环状DNA＞线状DNA＞单链开环DNA。
二、影响电泳迁移率的外界因素：
1、电场强度：
一般来说，电场强度越高，带电颗粒移动速度越快。
2、溶液pH：
溶液pH决定被分离物的解离程度和质点的带电性质及所带净电荷量。
溶液pH离pl越远，质点所带净电荷越多，电泳迁移率越大。因此，电泳时，应根据样品性质选择合适的pH值缓冲液。
3、溶液离子强度：
电泳液中的离子增加，会使电泳迁移率降低。原因是带电的离子会吸引相反符号的离子聚集在其周围，形成一个与运动离子符号相反的离子氛，使该离子向相反的方向运动，从而降低该离子的迁移率。
4、温度：
电泳过程中，由于通电会产生焦耳热，焦耳热对电泳有很大的影响。温度每升高1℃，迁移率增加约2.4%。
为降低热效应对电泳的影响，可控制电压、电流和在电泳系统中安装冷却散热装置。
5、支持物：
支持物的吸附作用要小，否则电场强度不均匀，影响区带分离，使实验结果无法重复。
6、电渗流：
电渗流速度的微小变化会影响分离结果的重现性。
