高效毛细管电泳色谱仪是以毛细管为分离通道，以高压电场为驱动力，以样品多样性为根据的液相微分离技术，是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展，使分析科学从微升级进入到纳升级水平，不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能，也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。
高效毛细管电泳仪在技术上采取了三项重要改进：
1、采用了50μm内径的毛细管。
2、采用了高达数千伏的高电压。
3、实现了高灵敏度的在线检测。
毛细管的使用使产生的热量能够较快散发，大大减小了温度效应，可使用很高的电压。电压升高，电场推动力大，又进一步使毛细管内径变小，柱长增加，理论塔板数可达几十万块/米，特殊柱子高达数百万块/米。
与传统电泳仪比较，高效毛细管电泳仪具有三高二少的特点。
1、高灵敏度：
紫外检测器的检测下限可达10ˉ1～10ˉ15mol，激光诱导荧光检测器可达10ˉ19～10ˉ21mol。
2、高分辨率：
HPLC一般为几千至几万。
3、高速度：
可在3min内分离30种阴离子，1.7min内分离19种阳离子，4min内分离10种蛋白质。
4、样品少：
只需纳升级进样量。
5、成本少：
只需几毫升流动相和价格低廉的毛细管。
由于以上重要改进，使高效毛细管电泳仪成为近年来发展较迅速的分离分析技术之一。
