高效气相色谱仪速率理论方程为：H = A + B/u + Cu
式中：A = 2λdp
B = 2rDg
C = Cm + Cs = 0.01k2/[（1+k）2]×dp2/Dm + q×[k/（1+k）2]×df2/Ds
高效气相色谱仪色谱柱的填充均匀度、载体粒度、载气种类及流速、固定液液膜厚度和柱温等因素对柱效产生直接影响，有些因素影响方向相反，应完整综合考虑。
一、流动相优质流速选择：
u对B/u和Cu的影响相反，使得u对柱效的总影响存在着一个优质流速。
在H－u图上有一个较低点，使B/u和Cu之和较小，这个点上的H称为较小理论塔板高度Hmin，u称为优质流速u优质。
二、载气选择：
当流速较小时，应选择分子量较大的载气（如N2和Ar）。
当流速较大时，应选择分子量较小的载气（如H2和He）。
还应考虑载气对不同检测器的适应性。
三、柱温选择：
柱温不能高于固定液的较高使用温度，以免引起固定液的挥发流失。在使较难分离组分能尽可能好的分离的前提下，尽可能采用较低的温度，但以保留时间适宜，峰形不拖尾为度。
四、固定液用量：
载体表面积越大，固定液用量可以越高，允许的进样量越多。但为了改善液相传质，应使固定液膜薄一些。
五、对载体的要求：
载体表面积要大，表面和孔径要均匀，粒度要求均匀、细小（但不宜过小以免使传质阻力过大）。
六、进样量：
进样速度要快，进样量要少，一般液体样品为0.1～5uL，气体样品为0.1～10mL。
七、气化温度：
气化温度要高于柱温30～70℃。
