高效液固吸附色谱仪流动相对样品的洗脱有重要作用，对选定了固定相的高效液固吸附色谱分离有重要的影响。选择流动相时考虑的三个因素：
一、被分离组分的结构、极性和吸附能力：
极性越大，越易被吸附。
1、烷烃类非极性化合物不易被吸附。
2、不饱和烃类极性越强，越易被吸附。
3、母核相同化合物，官能团极性越大，整个分子极性越大，越易被吸附。
4、形成分子内H键时，被吸附力减弱。
5、同系物中，分子量越大，极性越小，被吸附力越弱。常见官能团的极性大小顺序：烷烃＜烯烃＜醚类＜硝基化合物＜酯类＜酮类＜醛类＜硫醇＜胺类＜醇类＜酚类＜羧酸类。
二、吸附剂活性与被分离组分极性的关系：
1、分离极性小的组分，一般选择吸附性大的吸附剂，以免组分流的太快而难分离。
2、分离极性大的组分，宜选择极性小的吸附剂，以免吸附过牢而不易洗脱。
三、洗脱剂极性与被分离组分极性的关系：
样品吸附在色谱柱上后用合适的溶剂进行洗脱，这种溶剂称为洗脱剂。
1、洗脱剂选择原则：按相似相溶原理选择。
2、常用洗脱溶剂的极性大小顺序：己烷、石油醚＜环已烷＜四氯化碳＜三氯乙烯＜二硫化碳＜甲苯＜苯＜二氯甲烷＜三氯甲烷＜乙酸乙酯＜丙酮＜丙醇＜乙醇＜甲醇＜水＜吡啶＜乙酸。
