由高效色谱仪速率理论方程可知，引起色谱峰展宽的柱内因素有组分分子在色谱柱内运行的涡流扩散、分子扩散、传质阻力和色谱柱几何尺寸。
一、涡流扩散：
当样品注入全多孔微粒固定相填充柱后，在液体流动相驱动下，样品分子不可能沿直线运动，而是不断改变方向，形成紊乱似涡流的曲线运动。由于样品分子在不同流路中受到的阻力不同，而在色谱柱中的运行速度有快有慢，加上运行路径的长短不一致，使其到达柱出口的时间不同，因此引起色谱峰展宽。
采用细粒度和颗粒均匀的填料，均匀填充，可减少涡流扩散。
二、分子扩散：
纵向分子扩散是由浓度梯度引起的。当样品被注入色谱柱时，呈“塞子”状分布。随着流动相的推进，“塞子”因浓度梯度而向前后自发地扩散，使色谱峰展宽。
采用球状颗粒填料、相对分子质量较大的流动相和短柱，降低柱温，提高流动相流速，可减少分子扩散。
三、传质阻力：
传质阻力包括流动相传质阻力和固定相传质阻力。
样品组分由流动相移向固定相表面进行两相之间的质量交换是根据分配系数在两相之间进行分配的，有的组分来不及进入两相界面被流动相带走，有的组分进入两相界面又来不及返回流动相。这样使得样品在两相界面上不能瞬间达到分配平衡，从而引起滞后现象，使色谱峰展宽。
样品组分由两相界面到固定相内部进行分配又返回两相界面的过程中受到的阻力，从而使色谱峰展宽。
采用细粒度的填料和相对分子质量较小的流动相，提高柱温，降低液膜厚度和流动相流速，可减少传质阻力。
四、色谱柱几何尺寸：
减小色谱柱内半径，增大色谱柱螺管半径，可降低色谱峰展宽。
