高效毛细管电泳仪(HPCE)除了比高效液相色谱仪(HPLC)具有效率更高、速度更快、样品和试剂耗量更少、应用面更广等优点外,其仪器结构也比HPLC简单。HPCE只需高压直流电源、进样装置、毛细管和检测器,前三个部件均易实现,困难之处在于检测器,特别是光学类检测器。由于HPCE溶质区带的超小体积的特性导致光程太短,而且圆柱形毛细管作为光学表面也不够理想,因此,对检测器灵敏度要求相当高。
当然在HPCE中也有有利于检测的因素,如在HPLC中,因稀释,溶质到达检测器的浓度一般是其进样端原始浓度的1%,但在HPCE中,经优化实验条件后,可使溶质区带到达检测器时的浓度和在进样端开始分离前的浓度相同。在HPCE中还可采用堆积等技术使样品达到柱上浓缩效果,使初始进样体积浓缩为原体积的1%~10%,这对检测十分有利。从检测灵敏度的角度来说,HPLC具有良好的浓度灵敏度,而HPCE提供了很好的质量灵敏度。
检测器是HPCE的关键,发展很快。迄今为止,除了原子吸收光谱和红外光谱未用于HPCE外,其它检测手段均已用于HPCE。