在高效分配色谱仪中，根据相似相溶原则选择固定液，即选择与样品性质相近的固定液。
一、分离非极性样品：
一般选择非极性固定液。
非极性固定液与组分之间的作用力主要是色散力。
样品中各组分按沸点高低顺序分离。沸点低的组分先出峰，沸点高的组分后出峰。
对于含有同沸点的烃类和非烃类样品，极性组分先出峰。
二、分离中等极性样品：
一般选择中等极性固定液。
中等极性固定液与组分之间的作用力主要是诱导力和色散力。
样品中各组分按沸点高低顺序分离。沸点低的组分先出峰，沸点高的组分后出峰。
对于含有同沸点的极性和非极性样品，由于诱导力起主要作用，使极性组分与固定液之间的作用力加强，所以非极性组分先出峰。
三、分离强极性样品：
一般选择强极性固定液。
强极性固定液与组分之间的作用力主要是静电力。
样品中各组分按极性大小顺序分离。极性小的组分先出峰，极性大的组分后出峰。
对于含有极性和非极性的样品，非极性组分先出峰。
四、分离能形成氢键的样品（如醇、酚、胺和水的分离）：
一般选择强极性或氢键型固定液如腈醚和多元醇等。
氢键型固定液是强极性固定液中特殊的一类，与组分之间的作用力主要是氢键作用力。
样品中各组分按与固定液之间形成氢键的能力大小顺序分离。不易形成氢键的组分先出峰，易形成氢键的组分后出峰。
五、分离复杂的、难分离的样品：
可选择两种或两种以上的混合固定液。
可将两种或两种以上不同极性固定液按一定比例混合后，涂渍在载体上（混涂）。
可将分别涂渍不同极性固定液的载体按一定比例混匀后，装入一根色谱柱内（混装）。
可将不同极性的色谱柱串联起来使用（串联）。
六、分离含异构体的样品（主要是含芳香型异构体）：
一般选择特殊保留作用的有机皂土和液晶作固定液。
如苯系物的分离，苯系物指苯、甲苯、乙苯、二甲苯（包括对位、间位和邻位等同分异构体）、异丙苯和三甲苯等。使用有机皂土固定液，能使间位和对位二甲苯分开，但不能使乙苯和对位二甲苯分开。若使用有机皂土配入适量邻苯二甲酸二壬醋的混合固定液，能将各组分分开。
以上是固定液的大致选择原则，应用时有一定的局限性。样品在高效分配色谱仪中的作用比较复杂，因此，固定液的选择应主要靠实践。
