高效气相色谱仪分离条件的选择包括固定相、固定液配比、柱内径、柱长、柱温、载气种类、载气流速、进样方式、进样量和气化温度等选择。
一、固定相的选择：
根据相似相溶的原则选择。
二、固定液配比的选择：
配比是指涂在载体上的固定液与载体的质量之比。配比通常在5%～25%。
配比越低，载体上形成的液膜越薄，传质阻力越小，柱效越高，分析速度越快。
分析工作中通常使用较低的配比。
三、柱内径的选择：
柱内径一般为3～4mm。
样品量有限时，可使用小内径柱。
四、柱长的选择：
分离度与柱长的平方根成正比，增加柱长对分离度有利，但会使组分的保留时间增加，柱阻力增加。
柱长的选择原则是在满足分离目的的前提下，尽可能选用较短的柱子。
填充色谱柱的柱长通常为1～3m。
五、柱温的选择：
柱温升高，分离度下降，保留时间缩短，色谱峰变窄变高。
柱温下降，分析时间延长。两组分的相对保留值增大的同时，两组分的峰宽也在增加，当后者的增加速度大于前者时，两峰的交叠更为严重。
柱温选择原则：
1、柱温控制在固定液的较高使用温度（超过该温度固定液易流失）和较低使用温度（低于此温度固定液以固体形式存在）之内。
2、在达到分离度要求的条件下，选择低柱温。柱温一般选择接近或略低于组分平均沸点时的温度。
3、组分复杂和沸程宽的样品，采用程序升温。
六、载气种类的选择：
1、载气对柱效的影响：
由速率理论方程H = A + B/u + Cu可知，分子纵向扩散项与流速成反比，传质阻力项与流速成正比，故必有一优质载气流速使色谱柱的理论塔板高度较小，柱效较高。
当载气流速较小时，分子纵向扩散项起主要作用，选用摩尔质量较大的气体（如N2和Ar）作为载气，可抑制样品的纵向扩散，提高柱效。
当载气流速较大时，传质阻力项起主要作用，采用摩尔质量较小的载气（如H2和He），可减小传质阻力，提高柱效
2、检测器要求：
载气的选择应考虑检测器的种类。
在氢火焰检测器中，载气专业N2。
在热导池检测器中，使用热导系数较大的H2，有利于提高检测灵敏度。
3、载气性质：
载气的安全性、经济性和来源是否广泛等因素。
七、载气流速的选择：
实际流速通常稍大于优质流速，以缩短分析时间。
八、进样方式的选择：
1、气体样品采用气体进样阀进样。
2、液体样品采用色谱微量进样器进样，规格有1uL、5uL和10uL等。
九、进样量的选择：
进样量应控制在柱容量允许范围和检测器线性检测范围之内。进样要求动作快，时间短。
十、气化温度的选择：
色谱仪进样口下端有一气化器，液体样品进样后，在此瞬间气化。
气化温度一般较柱温高30～70℃。
防止气化温度太高造成样品分解。
