电泳色谱仪分类有多种。
1、按分离目的可分：实验室电泳色谱仪和工业电泳色谱仪。
2、按分离装置可分：毛细管电泳色谱仪和芯片电泳色谱仪等。
3、按分离对象的荷电性质可分：阴离子电泳色谱仪、阳离子电泳色谱仪和中性分子电泳色谱仪。
4、按分离对象的离子属性可分：无机离子电泳色谱仪和有机离子电泳色谱仪。
5、按分离特征可分：高选择性电泳色谱仪、高灵敏度电泳色谱仪和高分离度电泳色谱仪。
6、按灵敏性可分：微量电泳色谱仪和痕量电泳色谱仪。
7、按作用可分：定量分析电泳色谱仪和定性分析电泳色谱仪。
8、按固定相和流动相的极性大小可分：正相电泳色谱仪和反相电泳色谱仪。
9、按分离规模可分：微型电泳色谱仪、小型电泳色谱仪和大型电泳色谱仪。
10、按洗脱方式可分：等度洗脱电泳色谱仪和梯度洗脱电泳色谱仪。
11、按功能可分：分析型电泳色谱仪和制备型电泳色谱仪。
12、按固定相物理状态可分：液液电泳色谱仪和液固电泳色谱仪。
13、按产地可分：国产电泳色谱仪和进口电泳色谱仪。
14、按进样自动性可分：自动进样电泳色谱仪和手动进样电泳色谱仪。
15、按应用范围可分：推荐型电泳色谱仪和通用型电泳色谱仪。
16、按分离化合物的分子量可分：小分子电泳色谱仪和大分子电泳色谱仪。
17、按分离对象的属性可分：有机物电泳色谱仪和无机物电泳色谱仪。
18、按分离原理可分：分配电泳色谱仪、离子交换电泳色谱仪和凝胶电泳色谱仪等。
19、按用途可分：生物电泳色谱仪、制药电泳色谱仪、化工电泳色谱仪、食品电泳色谱仪、蛋白质电泳色谱仪、多肽电泳色谱仪、氨基酸电泳色谱仪、核酸电泳色谱仪、酶电泳色谱仪、DNA测序电泳色谱仪、基因电泳色谱仪、细胞电泳色谱仪、生物活性分子电泳色谱仪、糖类电泳色谱仪、抗生素电泳色谱仪、维生素电泳色谱仪、两性离子电泳色谱仪、医用电泳色谱仪、血液电泳色谱仪、血清电泳色谱仪、血浆电泳色谱仪、免疫电泳色谱仪、手性对映体电泳色谱仪、农药电泳色谱仪、兽药电泳色谱仪、土壤电泳色谱仪和水质电泳色谱仪等。
