高效液相色谱仪分析中影响液相微萃取效率的因素有萃取剂、萃取剂体积、样品溶液pH值、盐效应、萃取时间、搅拌速度和温度等。
一、萃取剂：
液相微萃取的萃取效果和使用的萃取剂密切相关，选择合适的有机溶剂是提高萃取效率的关键。萃取剂选择的基本原则是根据相似相溶原理。
1、分析物在萃取剂中的溶解度越大，萃取效果越好。
2、萃取剂的挥发性小，在水相中的溶解度应尽可能小，以减小溶剂损失。
3、萃取剂必须是毒性小和对环境危害小的溶剂。
4、在进行后序色谱分析时，溶剂必须易于与分析物分离。
5、对于项空液相微萃取，溶剂还需有较高的沸点和较低的蒸气压，以减少在萃取过程中的挥发。
6、对于中空纤维液相微萃取，溶剂的选择更为重要。所选用的溶剂除满足萃取剂的选择基本原则外，还要与纤维有良好的亲和力（能稳定存在于多孔孔隙中）和有适当的粘度（防止因扩散而损失）。
二、萃取剂体积：
一般来说，液滴体积越大，分析物的萃取量越大，有利于提高灵敏度。但由于分析物进入液滴是扩散过程，液滴体积越大，萃取速度越小，达到平衡所需的时间越长。
三、样品溶液pH值：
在液相微萃取过程中，分析物的疏水性越大，离子化程度越低，其水溶性越小，在有机相中的分配系数越大。而化合物的离子化程度不仅受其本身电离常数（电离部分与未电离部分平衡时的常数）的影响，也受其所在溶液的pH值影响。为了得到更好的萃取效果，提高分析物在有机相中的分配系数，通常是通过调整样品溶液的pH值来提高分析物在有机相中的分配系数。
四、盐效应：
由于分析物在萃取剂和样品之间的分配系数受样品基体的影响，当样品基体发生变化时，分配系数也发生变化。通过向样品中加入一些无机盐类（如NaCl 和Na2SO4等），可增加溶液的离子强度，增大分配系数，从而提高分析物在有机相中的分配，这是提高灵敏度的有效途径。
盐效应是有机萃取中提高萃取效率常用的方法。但对于某些体系，在其中加入盐对萃取效果没有影响，甚至可能降低萃取效果。
五、萃取时间和搅拌速度：
液相微萃取是目标分析物在样品与萃取剂之间分配平衡的过程，萃取效率与时间长短有关。在达到平衡前，目标分析物的萃取量随着萃取时间的延长而增大，一般来说，萃取时间越长，萃取效果越好。增加搅拌速度可加速分析物由样品溶液向萃取剂中扩散，提高萃取速度，缩短水溶液与萃取剂之间的平衡时间，减小萃取剂的溶解损失。
对于中空纤维液相微萃取，为了获得较高的回收率，可适当延长萃取时间。但萃取时间不能太长，否则中空纤维壁孔中的有机相会损失，萃取效率反而降低。所以要严格控制萃取时间，既保证萃取效率较大，又能得到良好的实验重现性，萃取时间一般为30～60min。此外，可通过快速搅拌来增加扩散系数，提高萃取速度和回收率，但搅拌速度不能太高，否则易产生气泡并吸附在中空纤维表面，促使溶剂挥发，而降低萃取效率。
六、温度：
一般来说，温度对液相微萃取有两方面的影响：温度升高，分析物向萃取剂的扩散速度增大，对流加强，有利于缩短达到平衡的时间。但是，升温会使分析物的分配系数减小，导致其在萃取剂中的萃取量减少。所以，实验时应兼顾萃取时间和萃取效果，寻找优质的工作温度。
七、其它：
样品溶液的粘度和基质种类等也会影响萃取速度和回收率。
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