液相色谱仪有液液分配色谱仪、液固吸附色谱仪、化学键合色谱仪、离子交换色谱仪、离子对色谱仪和空间排阻色谱仪等。分离机理如下：
一、液液分配色谱仪分离机理：
通过组分在固定相和流动相间的多次分配进行分离。
可以分离各种无机物和有机物。
二、液固吸附色谱仪分离机理：
通过组分在固定相和流动相间的多次吸附与解吸平衡而实现分离。
较适宜分离的物质是中等相对分子量的油溶性样品。凡是能够用薄层色谱仪分离的样品均可用液固吸附色谱仪分离。
三、化学键合色谱仪分离机理：
由于化学键合色谱仪中的键合基团不能全部覆盖具有吸附能力的载体，所以同时遵循吸附和分配的机理。
可以分离各种无机和有机物。
四、离子交换色谱仪分离机理：
通过组分与固定相间亲和力的差别进行分离。
各种离子和溶液中能够离解的物质均可分离，包括无机物、有机物和生物分子化合物（如氨基酸、核酸和蛋白质等）。
五、离子对色谱仪分离机理：
样品组分进入色谱柱后，组分的离子与对离子相互作用生成中性化合物，被固定相吸附或分配而实现分离。
可以分离各种有机酸、碱，特别是核酸、核苷和生物碱等。
六、空间排阻色谱仪分离机理：
利用凝胶固定相的孔径与被分离组分分子的相对大小关系进行分离。
