实验室离心机分离效果除与离心机种类和离心方法等因素有关，离心机转速、分离时间、分离温度和介质溶液PH值等条件也至关重要。
一、离心机转速：
离心力大小取决于转子的转速和离心半径。在说明离心条件时，低速离心通常以转子每分钟的转数（rpm）表示。在高速离心，特别是超高速离心时，往往用相对离心力（RCF）表示。实际工作中，离心力通常指相对离心力的平均值，即离心管中点的离心力。
二、分离时间：
分离时间因离心方法不同而有差别。
对于差速离心，分离时间是指颗粒完整沉降到离心管底的时间。
对于速率区带离心，分离时间是指形成界限分明的区带的时间。
对于等密度区带离心，分离时间是指颗粒完整到达等密度点的平衡时间。
对于速率区带离心所需的区带形成时间和等密度区带离心所需的平衡时间，影响因素很复杂，可通过试验确定。
三、分离温度：
为了防止分离物质的凝集、变性和失活，除了注意离心介质的选择外，还必须控制好分离温度，分离温度一般控制在4℃左右。对于热稳定性较好的物质，可在室温下进行离心分离。在高速离心或超高速离心时，转子高速旋转会发热从而引起温度升高，必须采用冷冻系统，使温度保持在一定范围内。
四、介质溶液PH值：
离心介质溶液PH值应该处于分离物质稳定的PH范围内，必要时可采用缓冲液。另外，过酸、过碱可能引起转子和离心机其它部件的腐蚀，应尽量避免。
